TopoGEN松弛的pHOT-1质粒DNA底物,测定DNA旋转酶超螺旋活性

上一篇 / 下一篇  2024-11-15 15:38:49/ 个人分类:生化试剂

松弛pHOT-1是一种适用于测定DNA旋转酶超螺旋活性的DNA质粒。它也可用于测定DNA连接数的变化,以评估插层。使用高纯度topo I弛豫反应制备质粒,然后对弛豫产物进行灭活和再纯化。TopoGEN随后验证每批的松弛状态,并验证底物可以被大肠杆菌DNA旋转酶和金黄色葡萄球菌DNA旋转酶超螺旋化。

 

这种质粒非常适合检测任何拓扑异构酶。pHOT-1相对较小(<3KB),非常适合展示中间态拓扑异构体。由于所有拓扑异构酶都表现出简并的DNA结合和切割序列,pHOT-1将有效地支持广泛的拓扑异构酶活性。超螺旋pHOT-1pBR322的缩小衍生物,优化以获得更高的产量。对于希望评估人类拓扑异构酶I在单一序列上的切割的研究者,它还有一个额外的特性:我们包含了人类拓扑异构酶I的首选结合位点(由Westergaard及其同事描述的十六核苷酸序列,见Bonven等人,1985年),该序列源自四膜虫核糖体基因重复序列。这个构建作为拓扑异构酶I切割底物非常有用,因为在没有喜树碱的情况下,酶在十六核苷酸位点有效切割。这允许研究者严格评估新的潜在拓扑异构酶I抑制剂,因为单一背景切割是内置的对照;如果该剂刺激在包含十六核苷酸位点的片段的这个和/或任何其他序列的切割,明显的切割很容易被揭示出来。通常,很难在DNA上捕获拓扑异构酶I切割;必须使用更多的酶,因为切割复合物会消耗酶的化学计量。由于这个原因,分析DNA切割需要更高水平的酶。该片段可以从多克隆位点使用下面显示的位点分离出来(Maniatis克隆书中的协议),末端标记并用作切割底物。

81.png

艾美捷TopoGEN松弛的pHOT-1质粒DNA底物:

编号:TG2035

分类:DNA底物

标签:dna底物,pHOT1,松弛DNA底物,松弛pHOT1

存储缓冲液:所有DNA都存储在TE缓冲液(10 mM Tris-ClpH 7.5),1 MM EDTA)中,浓度如上右上角指定。

存储和运输条件:这些DNA应存储在4°C下。DNA在常温下运输(或可能与酶运输一起在干冰上运输)。

 

质量控制分析:

?使用A260/A280比率法光谱测定纯度。在最适Gyrase活性条件下孵育,未导致任何可检测的DNA转化为缺口或线性DNA形式。

?对于超螺旋和松弛的DNA底物,超过85%DNA将呈超螺旋(形式IDNA,其余为缺口开放环状(形式IIDNA。没有可检测的线性DNA形式。

 

松弛的pHOT-1质粒DNA底物相关产品:

KinetoplastDNA(kDNA)

Supercoiled pHOT-1Plasmid DNA Substrate

Decatenated kDNA

 

艾美捷科技是TopoGEN的中国代理商,为科研工作者提供优质的产品与服务。

 

https://www.amyjet.com/brand/TopoGEN.shtml


TAG: topogen

 

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